Misi SMP Islam Terpadu Al-Anwar Kabupaten Mojokerto sebagai berikut:
1. Menumbuh suburkan fitrah iman yang bersih

2. Menanamkan ikhlas beribadah dan beramal sholeh

3. Mengembangkan daya pikir, dzikir dan skill secara optimal

4. Mewujudkan lingkungan sekolah Adiwiyata yang asri dan nyaman untuk kegiatan pembelajaran peserta didik

5. Mewujudkan satu lembaga yang:

6. Melestarikan fungsi lingkungan

7. Mencegah terjadinya pencemaran lingkungan

8. Mencegah terjadinya kerusakan lingkungan